Секретные материалы: Борьба за будущее

Малдер и Скалли должны сразиться с правительством и узнать правду об инопланетной колонизации Земли…

Действие фильма происходит в 35000 г. до н.э., во время ледникового периода, на территории Северного Техаса. Два пещерных охотника встречают в пещере большую внеземную форму жизни, которая убивает одну и заражает другую субстанцией, похожей на черное масло. В 1998 году в том же районе мальчик упал в яму и заразился черным веществом, просачивающимся из-под земли. Пожарные, которые входят в яму, чтобы спасти его, не выходят. Группа мужчин в защитных костюмах прибывает и извлекает тела мальчика и пожарных. Тем временем специальные агенты ФБР Фокс Малдер и Дана Скалли во время расследования угрозы взрыва федерального здания в Далласе, обнаруживается бомба в здании через улицу. По мере того, как здание эвакуируется, ответственный специальный агент Дариус Мишо остается, якобы для того, чтобы обезвредить бомбу. Однако он просто ждет, пока бомба взорвется.

Позднее Малдер и Скалли были наказаны, потому что, помимо Мишо, во время взрыва в здании находились еще четыре человека. В тот вечер к Малдеру обращается параноидальный врач Элвин Курцвейл, который объясняет, что «жертвы» уже мертвы и что взрыв был устроен, чтобы скрыть причину их смерти. В морге больницы Скалли может осмотреть одну из жертв, обнаружив признаки инопланетного вируса. Тем временем Курильщик отправляется в Техас, где доктор Бен Броншвейг показывает ему одного из потерянных пожарных, в теле которого обитает инопланетный организм. Он приказывает Броншвейгу сделать ему вакцину, но сжечь тело, если это не удастся. Позже инопланетный организм неожиданно вынашивает и убивает Броншвейга. Малдер и Скалли едут на место преступления в Техасе, где обнаруживают, что это место было поспешно превращено в новую игровую площадку, и встречаются с мальчиками, чей друг упал в яму. Следуя их указаниям, пара следует за поездом с несколькими белыми бензозаправщиками к большому кукурузному полю, окружающему два светящихся купола. Внутри куполов открываются решетки в полу и вылетают стаи пчел. Агенты убегают, преследуемые черными вертолетами, но им удается сбежать.

После возвращения в Вашингтон, округ Колумбия, Скалли переводят. Малдер опустошен, потеряв своего партнера. Они собираются поцеловаться, когда Скалли ужалила пчела, которая застряла под воротником ее рубашки; она теряет сознание, пока Малдер вызывает скорую, но водитель машины скорой помощи стреляет в Малдера и уводит Скалли прочь. Малдер, не получивший серьезных травм, выскальзывает из больницы с помощью «Одиноких стрелков» и помощника директора ФБР Уолтера Скиннера. Затем он встречает бывшего противника, Человека с хорошим маникюром., который сообщает ему местонахождение Скалли вместе с вакциной против вируса, который ее заразил. Когда Малдер уходит, Человек с хорошим маникюром убивает себя, взорвав заминированный автомобиль, прежде чем раскрывается его предательство Синдикату.

Малдер находит Скалли под землей в Антарктиде, в большом помещении, где много людей находятся в ледяных вольерах. Он нарушает заключение Скалли и использует вакцину, чтобы оживить ее, но это нарушает условия содержания и помещает инопланетян в кокон. Сразу после того, как агенты сбегают на поверхность, из-подо льда появляется огромное инопланетное судно и отправляется в небо. Малдер наблюдает, как оно исчезает вдалеке, когда Скалли приходит в сознание. Некоторое время спустя Скалли посещает слушание, на котором ее показания не принимаются во внимание, а доказательства скрываются. Она передает единственное оставшееся доказательство их испытания, пчелу, которая ее ужалила, отмечая, что ФБР в настоящее время не в состоянии исследовать эти доказательства. Снаружи Малдер читает статью о куполах и полях в Техасе; Скалли сообщает Малдеру, что она готова продолжить с ним работу.

На другой заставе в Тунисе Курильщик предупреждает Конрада Стругхолда, что Малдер остается угрозой, поскольку он объясняет, что Малдер узнал о вирусе. Затем он передает ему телеграмму, в которой сообщается, что блок Секретных материалов был повторно открыт.