Миссия невыполнима: Протокол Фантом

Итана Ханта обвиняют в нападении на Кремль, вынудившем правительство США инициировать «Призрачный протокол», в результате чего Итан должен очистить свое имя и предотвратить новые атаки. 

Во время выполнения задания в Будапеште, Венгрия, перехват курьера, работающего на человека под кодовым именем «Кобальт», агент МВФ Тревор Ханауэй убит французским убийцей по имени Сабин Моро. Руководитель группы Ханауэя Джейн Картер и недавно назначенный полевой агент Бенджи Данн вытаскивают Итана Ханта и Богдана из московской тюрьмы. Итан получает задание провести Джейн и Бенджи к секретным кремлевским архивам и найти файлы, идентифицирующие Кобальта. В середине миссии кто-то транслирует через частоту МВФ, предупреждая россиян о команде Итана. Хотя Итану, Бенджи и Джейн удаётся сбежать, Кремль разрушается бомбой, а российский агент Анатолий Сидоров обвиняет Итана в организации атаки.

МВФ вывозит Итана из Москвы. Русские называют это нападение необъявленным актом войны, а президент США активирует «Призрачный протокол». Итан и команда должны взять на себя вину за нападение, но им будет разрешено бежать из-под стражи правительства, чтобы они могли действовать, чтобы выследить Кобальта. Прежде чем Итан успевает сбежать, российские силы безопасности убивают секретаря МВФ во главе с Сидоровым, в результате чего Хант и аналитик разведки Уильям Брандт сами ищут выход. Команда идентифицирует Кобальта как Курта Хендрикса., русский ядерный стратег шведского происхождения, который считает, что слабые должны умереть, чтобы могли выжить сильные, поэтому он планирует начать ядерную войну, чтобы начать следующий этап человеческой эволюции. Хендрикс разбомбил Кремль и приобрел российское устройство управления запуском ядерного оружия, и теперь ему нужны его коды от будапештского курьера, чтобы запустить ядерную ракету по Америке.

Обмен между Моро и правой рукой Хендрикса, Мариусом Вистромом , должен состояться в Бурдж-Халифе.В Дубаи. Итан преследует Вистрома, Джейн задерживает Моро. Моро пытается убить неопытного Бенджи, и Джейн выбрасывает ее в окно. 

В то время как Итан ищет дополнительную информацию у Богдана, Брандт признает, что его назначили охранником Ханту и его жене Джулии. 

Богдан и его двоюродный брат-торговец оружием сообщают Итану, что Хендрикс будет в Мумбаи, Индия. Хендрикс содействовал продаже несуществующего советского военного спутника индийскому предпринимателю в области телекоммуникаций Бридж Натху., по которому можно было передать команду на запуск ракеты. Пока Брандт и Бенджи проникают в серверную, чтобы отключить спутник, Джейн заставляет Ната раскрыть код блокировки спутника. Но Хендрикс отключил серверы Ната перед тем, как послать сигнал с телевизионной башни на российскую атомную подводную лодку в Тихом океане. Итан преследует Хендрикса с пусковым устройством, в то время как другие члены команды пытаются вернуть радиостанцию в сеть. Хант и Хендрикс сражаются за устройство управления запуском. Бенджи убивает Вистрома, позволяя Брандту восстановить питание станции и дать возможность Итану деактивировать ракету.

Через несколько недель команда снова соберется в Сиэтле. Итан представляет команду бывшему коллеге Лютеру Стикеллу, а затем дает им новые задания. Бенджи и Джейн соглашаются, но Брандт отказывается принять миссию. Итан показывает, что смерть Джулии была инсценировкой, поскольку он знал, что не сможет защитить ее, и использовал ее смерть как предлог, чтобы проникнуть в российскую тюрьму и сблизиться с Богданом, источником информации о Хендриксе в МВФ. Брандт принимает миссию, в то время как Итан наблюдает за Джулией издалека, зная, что они снова будут вместе, когда будут в безопасности. Они улыбаются, прежде чем он отправится на свою следующую миссию.